Вам не нужно доставать эссенции из инвентаря. Там вы видите только их список.

Эссенции используются прямо из Коллекций. Откройте свои коллекции, и вы увидите поле с эссенцией напротив каждой коллекции, где указано, сколько нужно для её завершения.

Просто нажмите на кнопку Собрать напротив коллекции, для которой уже достаточно эссенций и найдены все предметы. Эссенции будут использованы, а их количество будет автоматически пересчитано в вашем Инвентаре и в других коллекциях, для которых нужны такие же эссенции.